Eine Arbeitsgemeinschaft der Universitäten Darmstadt, Frankfurt und Mainz hat sich zum Ziel gesetzt, 13 zerstörte Synagogen mit modernster Technik virtuell zu rekonstruieren. Die Dotter-Stiftung hat sich der Eberstädter Synagoge angenommen und diese Rekonstruktion in Auftrag gegeben. Die Stiftung möchte, dass darüber hinaus auch ein physisches Modell der Synagoge als Zeichen des Gedenkens geschaffen wird. Dies ist heute mit der Technik des 3D-Drucks möglich. Es wird ein Schnittmodell sein, in welchem man nicht nur die Außenfassade, sondern auch die Inneneinrichtung sehen kann.
Das 3D-Schnittmodell soll ein starkes Zeichen des gemeinschaftlichen Gedenkens und Erinnerns an unsere Eberstädter jüdischen Glaubens sein, von denen die Mehrzahl noch fliehen konnte, viele jedoch ermordet worden sind. Deshalb wird das Modell der Synagoge am 110. Jahrestag ihrer Einweihung am 7. September 2025 im Rahmen einer Gedenkfeier mit jüdischer Musik der Eberstädter Gemeinschaft übergeben werden.